arXiv cs.AI· Sitong Chen, Xiaopeng Mao·2026-09-29 12:00· 1 天前AI 评分29

用 GNN SchNet 从 3D 结构预测跨膜蛋白拓扑

Predicting Transmembrane Protein Topology from 3D Structure

AI 导读

研究用图神经网络 SchNet 从 3D 结构推断跨膜蛋白拓扑，训练数据与 DeepTMHMM 相同，并采用 5 折交叉验证。模型不使用任何预训练权重，且不同于只用蛋白序列或 α-carbons 作特征的做法，改用全部原子级嵌入向量。结果显示 GNN 在拓扑预测上具备潜力。

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