Topos Bio 发布 10 万+ 无序蛋白-配体全原子 MD 数据集 Topos-DB

Topos Bio 发布 Topos-DB，用全原子分子动力学（MD）模拟构建了超过 10 万个无序蛋白-配体体系，以填补公共数据库缺乏大规模无序蛋白-配体训练数据的空白。按不同体系数量计，该数据集据称是目前最大的全原子蛋白 MD 数据集，约为第二名的 3 倍。评论区有人建议此类工作结合 MLIP（机器学习原子间势）来做，作者表示认同。